下载地址:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/ 我一般是使用linux版本的：wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/ad...
结构变异检测检测软件breakdancer的安装和使用
一、安装breakdancer 1：在安装breakdancer之前必须先安装以下几个包 yum安装以下包： yum -y install perl yum install perl-ExtUtils...
群体遗传学—admixture软件快速群体分群
群体遗传学中测的很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看那几个物种聚在一起，一般使用的软件就是STRUCTURE，但是STREUTURE运行速度极慢，后面frappe软件提升了...
使用Python画ROC曲线以及AUC值
AUC介绍 AUC (Area Under Curve)是机器学习二分类模型中非常常用的评估指标，相比于 F1-Score 对项目的不平衡有更大的容忍性，目前常见的机器学习库中(比如 scikit-l...
SPSS：卡方检验的两两比较 _ 多组卡方检验及结果解读
卡方检验的两两比较，多个率之间的比较，其基本思想与两个率之间相同。例如：比较多种治疗方法对糖尿病的疗效。 【原理剖析】 对于多个频率分布比较的卡方检验，若结论为拒绝H0，多组之间存在差异，也即至少存在...
统计分析出现OR异常偏高怎么办
在临床研究中，当不能计算RR时，常用OR作为RR的估计值描述暴露与结局的关联强度，OR的计算不需要知道率，给我们的研究和分析带来方便。但在我们统计分析时，常常看到一些看起来不靠谱的OR，比如OR特别高...
cnvnator安装及使用方法简介
1、安装gcc 推荐yum安装，自己寻找依存关系，版本当在4.8以上。 2、安装root a、下载root_v6.03.04.source.tar.gz yum install git make gc...
两个变量都是多分类变量时，应该选用什么统计方法
两个分类变量都是多分类变量时，常称为R×C列表资料，也就是两个多分类变量。这种数据常分为以下几种情况：两个变量都是无序的、两个变量都是有序的、只有一个变量是有序的，下面我们分别进行讨论。这里仅限于数据...
SPSS:单向有序资料的统计检验
在临床资料的统计分析过程中，我们经常会遇到不同构成比的组间比较问题，这时候我往往会用卡方检验去解决。如A药的有效率为78%，B药的有效率为53%，比较两种药物疗效的差别。 但是如果药物的疗效评价指标不...
SPSS:数据的加权
在SPSS软件中，Data View(数据视图)在默认情况下每一行就是一条记录，通常情况下我们也是这样录入数据的。但是，在有些情况下我们得到的数据可能是已经初步汇总过的，如下面所说的情况，如果有168...