1. 背景知识 上一节中我们讲解了R语言在Cox回归模型中计算C-index的方法，参见：预测模型系列 05 -- Cox回归中C-index的两种常用计算方法。本节我们将介绍用R语言计算Logist...

1. 背景介绍 近十年来，临床研究中有一类预测模型构建与验证类的文章数量逐渐增多。简言之，预测模型是通过已知参数来预测临床未知的结局，而模型本身就是一个数学公式。也就是把已知的参数通过这个所谓的模型就...

感受野 在卷积神经网络中，感受野（Receptive Field）的定义是卷积神经网络每一层输出的特征图（feature map）上每个像素点在原始图像上映射的区域大小，这里的原始图像是指网络的输入图...

简单介绍F-statistics 和 Fst 1. 概念 在群体遗传学中，F-statistics（Fixation indices）是衡量种群中基因型实际频率是否偏离遗传平衡（哈温平衡）理论比例的指...

Fst，用于衡量种群分化程度，取值从0到1，为0则认为两个种群间是随机交配的，基因型完全相似；为1则表示是完全隔离的，完全不相似。它往往从基因的多样性来估计，比如SNP或者microsatellite...

1. 群体遗传分化的度量 （1）F-统计量 现实植物自然群体并非是理想群体，如果仅考虑单基因座上一对等位基因，对于由若干个地方群体组成的生物大群体，各层次现实群体中基因型频率期望值偏差一般用Fis、F...

概述 深度学习是一个广阔的领域，但我们大多数人在构建模型时都面临一些共同的难题 在这里，我们将讨论提高深度学习模型性能的4个难题和技巧 这是一篇以代码实践为重点的文章，所以请准备好你的Python I...

1. 如何选择参考基因组？——李恒2017年年底博客 1.1 三种选择 如果比对到GRCh37/hg19，使用： ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ft...

　推断统计的概念 推断统计是研究如何利用样本数据来推断总体特征的统计方法。包含两个内容：参数估计，即利用样本信息推断总体特征; 假设检验，即利用样本信息判断对总体的假设是否成立。 　　假设检验 正如一...

针对不同的变异类型，HGVS制定了相应的变异描述规则。本篇文章针对DNA水平不同变异类型进行命名格式介绍。 置换Substitution HGVS定义： a sequence change where...