配对样本t检验的前提条件: 1.两个样本必须是配对的,也就是相关的; 2.两个样本所来自的总体都应该服从正态分布,这是t检验使用的基本条件; 在医学和教学领域,配对样本t检验应用是非常多的,例如以下几...
利用SPSS进行生存分析的Cox回归模型(比例风险模型)
一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。...
利用SPSS进行独立样本四格表卡方检验:详细操作过程
如果我想看不同患者人群的术后复发率有没有差异,怎么办?这时候就需要欢迎我们的统计小助手——卡方检验闪亮登场啦! 卡方检验可是一位重量级选手,凡是涉及到计数资料分布的比较都需要他的帮忙。和t检验一样,卡...
转录组测序多少生物重复合适?
2016年英国邓迪大学的Geoffrey J Barton教授在RNA发表一篇文章专门评估这一问题。作者对野生型和snf2突变型酵母样品分别测序了48个生物学重复;质控后,野生型样品保留42个生物学重...
基于深度学习的超分辨率图像技术一览
超分辨率(Super-Resolution)即通过硬件或软件的方法提高原有图像的分辨率,图像超分辨率是计算机视觉和图像处理领域一个非常重要的研究问题,在医疗图像分析、生物特征识别、视频监控与安全等实际...
关于转录组比对STAR软件使用
因为不连续的转录本结构,相对短的片段长度,和测序技术持续增加的通量,高通量RNA-seq数据的准确比对是一个有挑战性且仍未解决的问题。当前可用的RNA-seq比对器遭受高比对错误率,低比对速度,片段长...
R绘图基础(10)热图 heatmap
我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
R绘图基础(9)坐标中断(axis breaks)
R当中的坐标中断一般都使用plotrix库中的axis.break(), gap.plot(), gap.barplot(), gap.boxplot()等几个函数来实现,例: gap plot &g...
R绘图基础(8)点柱图(dot histogram)
在之前的一节当中,图型名称有些混乱,从这一节开始将做如下统一(不全面): 英文名称 中文名称 bar 条形图 line 线图 area 面积图 pie 饼图 high-low 高低图 pareto 帕...
R绘图基础(6)各类图型
1、点,线,面 点:points,线:abline,lines,segments,面:box,polygon,polypath,rect,特殊的:arrows,symbols points不仅仅可以画...