由千年基因、广东省农科院、山东省农科院等单位共同启动的中国花生基因组计划取得丰硕成果,完成花生A基因组de novo测序、组装、注释及深入分析,得到花生A基因组大小约1.05Gb,并鉴定...
转录组组装工具StringTie
StringTie由约翰霍普金斯大学联合德州大学西南医学中心开发,能够组装转录本并预计表达水平。它应用网络流算法和可选的denovo组装,将复杂的数据集组装成转录本。 相对于其他拼接软件(Cuffli...
转录组差异表达分析工具Ballgown
Ballgown是分析转录组差异表达的R包。 1、软件安装: 运行R, source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("ballgown"...