超分辨率(Super-Resolution)即通过硬件或软件的方法提高原有图像的分辨率,图像超分辨率是计算机视觉和图像处理领域一个非常重要的研究问题,在医疗图像分析、生物特征识别、视频监控与安全等实际...
关于转录组比对STAR软件使用
因为不连续的转录本结构,相对短的片段长度,和测序技术持续增加的通量,高通量RNA-seq数据的准确比对是一个有挑战性且仍未解决的问题。当前可用的RNA-seq比对器遭受高比对错误率,低比对速度,片段长...
R绘图基础(10)热图 heatmap
我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
R绘图基础(9)坐标中断(axis breaks)
R当中的坐标中断一般都使用plotrix库中的axis.break(), gap.plot(), gap.barplot(), gap.boxplot()等几个函数来实现,例: gap plot &g...
R绘图基础(8)点柱图(dot histogram)
在之前的一节当中,图型名称有些混乱,从这一节开始将做如下统一(不全面): 英文名称 中文名称 bar 条形图 line 线图 area 面积图 pie 饼图 high-low 高低图 pareto 帕...
R绘图基础(6)各类图型
1、点,线,面 点:points,线:abline,lines,segments,面:box,polygon,polypath,rect,特殊的:arrows,symbols points不仅仅可以画...
R绘图基础(5)坐标轴,图例,标记与标题
相关参数来控制,它们有 参数 描述 main 主标题 sub 副标题 xlab x轴标记 ylab y轴标记 xlim x轴上下限(范围) ylim y轴上下限 mgp 坐标轴标记,坐标字符,坐标刻度...
R绘图基础(4)符号与线形
画图中的符号由pch参数来控制。其描边色由col控制,填充色由bg控制。 > pchShow <- + function(extras = c("*",".", "o","O","0","...
R绘图基础(3)字体
字体参数如下: 参数 描述 font 字体描述,1正常,2加粗,3斜体,4加粗,斜体,5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述...
R绘图基础(2)颜色
计算机保存及还原颜色时有多种方案,较为常用的是两个,RGB和HSV。R预设了657种颜色,可以通过colors()函数调用(或者英式拼写colours())。比如我们常用的红,绿,蓝, > co...