Transcriptomics

关于转录组比对STAR软件使用

因为不连续的转录本结构,相对短的片段长度,和测序技术持续增加的通量,高通量RNA-seq数据的准确比对是一个有挑战性且仍未解决的问题。当前可用的RNA-seq比对器遭受高比对错误率,低比对速度,片段长...
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R绘图基础(10)热图 heatmap

我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
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R绘图基础(3)字体

字体参数如下: 参数 描述 font 字体描述,1正常,2加粗,3斜体,4加粗,斜体,5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述...
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R绘图基础(2)颜色

计算机保存及还原颜色时有多种方案,较为常用的是两个,RGB和HSV。R预设了657种颜色,可以通过colors()函数调用(或者英式拼写colours())。比如我们常用的红,绿,蓝, > co...
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