相关参数来控制,它们有 参数 描述 main 主标题 sub 副标题 xlab x轴标记 ylab y轴标记 xlim x轴上下限(范围) ylim y轴上下限 mgp 坐标轴标记,坐标字符,坐标刻度...
R绘图基础(4)符号与线形
画图中的符号由pch参数来控制。其描边色由col控制,填充色由bg控制。 > pchShow <- + function(extras = c("*",".", "o","O","0","...
R绘图基础(3)字体
字体参数如下: 参数 描述 font 字体描述,1正常,2加粗,3斜体,4加粗,斜体,5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述...
R绘图基础(2)颜色
计算机保存及还原颜色时有多种方案,较为常用的是两个,RGB和HSV。R预设了657种颜色,可以通过colors()函数调用(或者英式拼写colours())。比如我们常用的红,绿,蓝, > co...
R绘图基础(1)布局
R绘图所占的区域,被分成两大部分,一是外围边距,一是绘图区域。 外围边距可使用par()函数中的oma来进行设置。比如oma=c(4,3,2,1),就是指外围边距分别为下边距:4行,左边距3行,上边距...
R绘图基础(7)综合应用
1、点阵图加两方向柱状图 > def.par <- par(no.readonly = TRUE) # save default, for resetting... > > x...
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正
数据分析中常碰见多重检验问题(multiple testing).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(False Discovery Rate)来决定P值的域值. 假设你挑选了...
假设检验p-value,FDR,q-value
一、p-value相关 0. 单个假设检验中主要依靠p值(或统计量t)做出是否拒绝零假设H0的决定:p-value和预先设定的检验水准alpha做对比,如果p-value小于等于alpha,拒绝原假设...
怎样在heatmap中使用多种cluster方法
生物信息学中经常使用R 来画图,而R画heatmap的功能是非常强大的。通常,我的习惯是使用gplots包中的heatmap.2函数来进行画图。不过这个函数中不能对聚类分析(clustering)到方...
DNA甲基化测序方法介绍
DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。 DNA 甲基化及CpG岛 DNA 甲...