【前言】其实这篇文章是为了简单介绍一下geneview的用法，它是一个Python高级库，建立在matplotlib的基础之上，专门用于基因组数据的可视化，目的是为了使创建高大上（精致）的基因组数据图...

本系列教程包括： 基因表达分析（上） 基因表达分析（中） 基因表达分析（下）   回顾 首先对基因表达分析（中）做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具：RNA-Seq，microarra...

本系列教程包括： 基因表达分析（上） 基因表达分析（中） 基因表达分析（下）   还在利用hisat, tophat这些耳熟能详的软件将read比对到基因组（转录组）上，然后统计每个基因的c...

本系列教程包括： 基因表达分析（上） 基因表达分析（中） 基因表达分析（下）   基因表达 什么是基因表达，如下是来自于维基百科的解释： Gene expression is the pro...

测序建库的时候，会加入一定比例的Phix，那么Phix文库有什么作用呢，我转了两篇文章，方便大家理解。Phix文库最主要的目的1）是调节碱基平衡，改善测序仪的空间校正，便于后期提高base calli...

《经济学人》常用的藏青色 经济学人上的图表，基本只用这一个颜色，或加上一些深浅明暗变化，再就是左上角的小红块，成为经济学人图表的招牌样式。罗兰贝格也非常爱用这个色，有时也配合橙色使用。各类提供专业服务...

概述 BEDTools是可用于genomic features的比较，相关操作及进行注释的工具。而genomic features通常使用Browser Extensible Data (BED) 或...

Samtools是一个用于操作序列比对结果sam和bam文件的工具合集。 sam文件格式 SAM格式由两部分组成：头部区和比对区，都以tab分列。 头部区:以’@’开始，体现了比对的一些总体信息。比对...

在转录组数据处理过程中我们经常会用到差异表达分析这一概念，通过比较不同处理或不同组织间基因表达量(FPKM)差异来寻找特异基因，但这前提是你的不同处理或不同组织样本较少，当不同处理或组织有较多样本，如...

ideogram在基因组绘图中往往表示的就是染色体，在大多数情况下，ideogram是配置文件中重要的部分，也是相对参数较多的circos配置文件。主要内容包括染色体的半径、宽度、颜色，染色体排列方式...