小编注：近年来RNA-Seq被广泛应用，衡量基因表达水平的方法也开始多样化，例如RPK, RPKM, FPKM, TPM等。那他们之间有什么样的区别、以及怎样换算呢。最近看到一篇不错的博客，这里与大家...
MTD(mammalian transcriptomic database)：哺乳动物动态转录本数据库
MTD（http://mtd.cbi.ac.cn）是今年初发表在Brings in Bioinformatics上的哺乳动物动态转录本数据库（http://bib.oxfordjournals.org...
RNA-Seq中样品间的标准化
In RNA-Seq, 2 != 2: Between-sample normalization In this post I will discuss between-sample normaliz...
Pileup格式介绍
Pileup format is first used by Tony Cox and Zemin Ning at the Sanger Institute. It desribes the base...
单细胞分析之Garnett
Garnett简介 分析原理 Garnett使用人工定义的marker基因信息来选择细胞，然后基于这些细胞使用弹性网络回归（elastic-net regression）的机器学习算法训练分类器。分类...
SPSS实操：单样本t检验
单样本t检验：主要用于检验单个变量的均值与指定检验值之间是否存在显著性差异。 我们以患者乳酸水平与正常值乳酸上限进行比较! 首先把数据导入SPSS软件中。 点击"分析(A)"，选择"比较平均值...
不同生物信息数据格式0，1起始
生物信息学很大一部分数据是基于基因组坐标的格式，由于坐标的0，1起始和区间开闭的区别，曾经给我造成了很大的困扰。 0，1起始的定义 格式对应表
机器学习算法性能评估常用指标总结
考虑一个二分问题，即将实例分成正类（positive）或负类（negative）。对一个二分问题来说，会出现四种情况。如果一个实例是正类并且也被 预测成正类，即为真正类（True positive）,...
个体重测序揭示籼稻品种RGD-7S和Taifeng B的DNA多态性
广东省农科院研究人员携手千年基因，揭示水稻品种RGD-7S和Taifeng B的杂交后代F1在种植早、晚期先后出现杂交劣势和杂交优势的遗传基础。 研究背景 两个籼稻品种RGD-7S和Ta...
转录组测序鉴定重金属植物宝山堇菜的CRPs
广东药学院与千年基因合作，运用转录组测序技术鉴定宝山堇菜中的富半胱氨酸蛋白种类，以期为后续解析富半胱氨酸蛋白参与的抗逆防卫机制提供基础。研究结果发表在Journal of Plant Physiolo...