前言 L1/L2正则化的目的是为了解决过拟合，因此我们先要明白什么是过拟合、欠拟合。 过拟合：训练出的模型在测试集上Loss很小，在训练集上Loss较大 欠拟合：训练出的模型在测试集上Loss很大，在...

生存分析是医学领域常见的分析方法，也可以拓展到其他专业领域。这篇帖子的目的就是介绍怎么做生存分析，希望能对临床医学的同学提供一定帮助。 简明扼要地讲，生存分析的目的无外乎六个字：描述、比较、关系。 1...

我们先来看一下不同平台数据格式： 1.    产出数据格式 Solexa—fastq 2.    产出数据格式 454—fasta   测序读长即每条测序读断的长度，所有平时大家叫的read...

由于生物信息的大部分工作都是在没有 root 权限的集群上进行的，本期主要介绍一下非 root 用户怎么安装群体遗传常用的软件。工欲善其事，必先利其器！ 准备工作 1、首先我们建一个文件夹，用来存储我...

Illumina 测序原理 在进入本期的正题之前，我们需要了解一下 Illumina 的测序原理，在这里用一张图简单的展示一下： 图1 Illumina 测序原理 (图片来自https://www.i...

今天给大家推荐一个高通量测序数据质控神器——Trimmomatic。这个于 2014 年发表在 Bioinformatics 上的软件，至今为止在 Web of Science 上可以检索到 2,09...

森林图是meta分析中hin重要又常见的元素，它以一条垂直的无效线为中心，用平行于横轴的多条线段表示每个被纳入研究的效应量和可信区间，用一个菱形描述合并的效应量及其可信区间。但，森林图具体怎么看呢?今...