Bioinformatics

扩增子分析QIIME2 简介和安装

声明:本文为QIIME2官方帮助文档的中文版,由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效,文档翻译己获QIIME2团队官方授权。由于QIIME2更新频繁,如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读...
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Bioinformatics

Co-occurrence网络图在R中的实现

作者:陈亮 单位:中科院微生物所, 编辑: 刘永鑫 编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的...
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Evolution

用iTOL轻松绘制高颜值系统进化树

时至今日,科研文章也紧随时代潮流,文章中各种高大上的配图层出不穷。究其原因主要包括两点:一是在科研数据和内容更加丰满而文章发表配图张数受限的情况下组合图更具实用性;二是一幅高颜值的配图不仅能提升文章的...
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Script

R语言聚类分析–cluster, factoextra

对于有很多(成百上千)研究对象时,把对象分组是最常用的研究手段。而通过观察值进行聚类是非常有效的方法,可以按事物观察值有效的合理分组,再进一步分析各组的相同、与不同,可以很好的发现其中的规律。 本文将...
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