今天跟大家分享的是一个在线TCGA基因表达和生存分析的工具（GEPIA2），2019年发表在NAR上，目前已更新到2.0版本，访问网址是http://gepia2.cancer-pku.cn/#ind...

随机对照试验中研究设计比较像八股文，无论平行设计还是交叉设计，个体随机还是整群随机，一般都要求在研究开始就应该确定研究的假设和统计假设，并通过合理的计算确定研究的样本量。但是，临床研究实际往往都比我们...

首先来了解一下三个概念： 1、adapter是一段短的序列已知的核酸链，用于链接序列未知的目标测序片段。 2、barcode，也称为index，是一段很短的寡居核酸链，用于在多个样品混合测序时，标记不...

Hi-C技术是高通量染色体构象捕获技术（High-throughput chromosome conformation capture）。 利用高通量测序技术，结合生物信息学分析方法，研究全基因组范围...

数据自身的质量在很大程度上决定了分析结果的准确和可靠，随着Hi-C技术在三维基因组学上的快速推广，对于Hi-C数据本身的质量和测序深度也逐渐引起研究人员的重视。同时对该技术的进一步优化和改进使之能够在...

声明：本文为QIIME2官方帮助文档的中文版，由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效，文档翻译己获QIIME2团队官方授权。由于QIIME2更新频繁，如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读...

作者：陈亮 单位：中科院微生物所， 编辑： 刘永鑫 编者按：上个月菌群月坛，在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验，不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识，更使我手上一个关于菌根的课题有极大的...

1.背景 GWAS研究产生了大量的SNP，大部分在非编码基因组 这些SNP其实是Lead/Tag SNP，所以需要同时关注与这些SNP处于高LD（linkage disequilibrium）的其它S...

线性判别分析LDA 线性判别分析，英文Linear Discriminant Analysis, 以下简称LDA。LDA在模式识别领域（比如人脸识别，舰艇识别等图形图像识别领域）中有非常广泛的应用，在...

时至今日，科研文章也紧随时代潮流，文章中各种高大上的配图层出不穷。究其原因主要包括两点：一是在科研数据和内容更加丰满而文章发表配图张数受限的情况下组合图更具实用性；二是一幅高颜值的配图不仅能提升文章的...