在进行数据分析时,常需要对原始数据进行适当的转换。也许需要将连续变量转换为分类变量(比如:将年龄转换为<30岁组和≥30岁组),或者将分类变量重新编码(比如:将血型A、B、O、AB转换为A型和其...
手把手教你临床 Meta 分析操作
这是一篇临床 Meta 分析连续性变量资料的操作流程,由于临床研究生时间紧迫,在有限的时间里阅读了大量的文献,却没有时间写一份质量上乘又会得到关注的综述性文章。本操作流程旨在一步一步教会临床的研究生在...
详细讲解NA-Seq基因表达水平衡量方法:RPKM, FPKM and TPM
小编注:近年来RNA-Seq被广泛应用,衡量基因表达水平的方法也开始多样化,例如RPK, RPKM, FPKM, TPM等。那他们之间有什么样的区别、以及怎样换算呢。之前PLoB上分享了一篇关于这方面...
单细胞数据降维可视化最新工具UMAP的介绍
高通量单细胞组学数据的一个显著性特点就是数据量大,一次能反映的细胞数量多。因此,通过降维和可视化去展示细胞数据特征是一个非常重要的工作。翻开各类发表的单细胞组学文章,不管是CNS的还是其他,几乎所有的...
GSEA法基因功能富集分析原理详解
GSEA是一种基于基因集的富集分析方法,在对基因表达数据分析时,首先确定分析的目的,即选择MSigDB中的一个或多个功能基因集进行分析,然后基于基因表达数据与表型的关联度(也可以理解为表达量的变化)的...
Seurat进行单细胞RNA-seq数据整合
单细胞RNA-seq很大的特点是数据量大,数据噪声高。因此在对一些特别小的类群进行分析,或者增加数据量降噪的情况下,我们往往需要将多个单细胞RNA-seq的数据集整合起来,这些数据集可能来自不同的研究...
西北农林科技大学“青年千人”马闯课题组招聘生物信息学科研人员
西北农林科技大学“青年千人”马闯课题组招聘生物信息学科研人员 西北农林科技大学(Northwest A&F University)简称“西农”或“西北农大”,坐落于农科城杨凌,是教育部直属全...
为什么很难建立准确的临床预测模型?
在今年中国医师协会循证医学分会的年会会前培训班上,来自北京儿童医院临床流行病和循证医学中心的彭晓霞教授讲课时提到了一篇题为《Why Is a Good Clinical Prediction Rule...
SPSS实操:两个独立样本均数比较的t检验
一、临床问题&科学问题 40例患者随机分配至A、B两组。每组 20例,A组接受常规液体复苏,B组在初步液体复苏后,接受限制性液体复苏,72h后,利用PICCO计算测量两组患者肺水含量,数据如下...
用Prism绘制“中断”柱状图
Prism也是一款比较经典好用的科研作图软件,在高分文章中经常出现它的身影,如下面的例子。它是一款从原始数据分析到图表生成“一站式”流程化的软件,例如它可通过Raw data 自动在图中生成误差线(e...