pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包。ComplexHeatmap包即是受之启发而来。你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同。在pheatmap的时代（请允...

ROC 曲线(receiver operating characteristic curve，简称 ROC 曲线)，以真阳性率(灵敏度)为纵坐标，假阳性率(1-特异度)为横坐标绘制的曲线。横纵坐标可由...

简介 sequence logo图用来可视化一段序列某个位点的保守性，据根提供的序列组展示位点信息。这方面有很多在线小工具可以完成，这里使用R包ggseqlogo进行可视化。 安装 安装方式有两种 #...

在利用深度学习模型分析DNA序列时，需要对DNA序列进行one hot encoding。以下是使用PyTorch对DNA序列进行One-hot编码的三种方法，并整合在一个代码中，同时计算不同方法处理...

先明确一点就是，Deep Learning是全部深度学习算法的总称，CNN是深度学习算法在图像处理领域的一个应用。 第一点，在学习Deep learning和CNN之前，总以为它们是很了不得的知识，总...

PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据降维算法。在数据分析以及生信分析中会经常用到。 本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘...

　　　　主成分分析（Principal components analysis，以下简称PCA）是最重要的降维方法之一。在数据压缩消除冗余和数据噪音消除等领域都有广泛的应用。一般我们提到降维最容易想到...

我们在研究中常常遇到这样的问题，用两个不同的检测方法评价同一群人，看看两种检测方法的判断是否有差异。举个例子，比如有新旧两台B超机器，用这两台B超机分别对100名体检者进行是否有脂肪肝;希望评价一下新...

随着基因组学与生物信息学关键技术的飞速发展，第二代测序技术（Next Generation Sequencing, NGS）已经成为常规分析的技术手段，第三代测序技术，即，单分子测序，也开始在很多重大...

一、临床问题&科学问题 一组高血压患者数据，其中患者体重指数以及腰臀比数据进行了收集。数据如下。所以回归分析，预测是其终极目的。现想知道体重指数为34的患者腰臀比为多少? 　　二、统计分析前的...