Tophat+cufflinks组合是RNA-Seq数据分析的一个很经典的分析方法了，四年前关于这两个软件的使用，Nature Protocol专门发文介绍如何使用这两个软件，具体可以参考《利用top...

个人认为理解并掌握这个logistic regression是学习神经网络和深度学习最重要的部分，也是最基础的部分，学完这个再去看浅层神经网络、深层神经网络，会发现后者就是logistic重复了若干次...

数据聚类然后展示聚类热图是生物信息中组学数据分析的常用方法，在R语言中有很多函数可以实现，譬如heatmap,kmeans等，除此外还有一个用得比较多的就是heatmap.2。最近在网上看到一个笔记文...

越来越多的研究表明，数据质量对于外显子组测序至关重要。当数据质量较低时，研究人员很可能会错过有用的变异信息。例如，埃默里大学医学院教授Madhuri Hegde在对一名视网膜营养不良患者进行外显子组测...

GPT-3，BERT，XLNet这些都是当前自然语言处理（NLP）的新技术，它们都使用一种称为 transformer 的特殊架构组件，这是因为，transformer 这种新机制非常强大，完整的tr...

肿瘤研究已经进入组学大数据时代，多组学技术已经广泛应用于癌症研究，尤其是用于剖析肿瘤不同生物学特点以发现生物标记物、增进对发病机制的认识、发现治疗方法等方面。但是大数据分析需要的专业统计学知识和计算机...

本文作者：Robert E. Kass; Brian S. Caffo; Marie Davidian; Xiao-Li Meng; Bin Yu; Nancy Reid 原文出处 Ten Simpl...

Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化，但是如果要通过ggplot2定制一套图形，尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形，对于那些没有深入了解ggplot2的人...

简介 近年来NLP领域最让人印象深刻的成果，无疑是以谷歌提出的Bert为代表的预训练模型了。它们不断地刷新记录（无论是任务指标上，还是算力需求上），在很多任务上已经能超越人类平均水平，还具有非常良好的...

上一篇《进化树+条形图：“组合图”的绘制》介绍了如何通过改变标尺来改变进化树分支长度和进化树的注释，相信大家对进化树与其他类型图表的组合有了一定的了解，局限于微信公众号的篇幅，其实还有好多东西没有讲到...