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三维基因组技术(四):Compartment 分析流程
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Compartment计算 2.Compartment 分析流程 2.1 Cworld-dekker软件的...
三维基因组技术(三):Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用
1.Hi-C原理简介 1.1 Hi-C技术高通量染色体构象捕获技术(High-throughput chromosome conformation capture)研究全基因组三维构象及分析染色质片段...
三维基因组技术(二):Hi-C辅助组装与Lachesis的使用
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装(PGA)技术原理 染色质在细胞核内分布的并不是随机分布的,而是不同染色体占据不同的空间...
三维基因组技术(一):简单介绍
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组空间三维结构与功能 染色质空间三维结构 染色体结构 DNA以一长串复杂的线圈形式堆积成染色体。DNA...
ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤
ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC...
基因富集通路图展示神器-Mapman的使用
大家还在为通路图中无法展示具体基因而发愁吗?还在为基因富集通路图展示出来不够美观而苦恼吗?今天小编给大家带来一款植物基因功能分析神器——Mapman,可帮您解决此问题,闲话不多说了,大家先找个安静的地...
Systemd Slice 配置与管理
1. /etc/systemd/system/user-.slice 的参数和选项 /etc/systemd/system/user-.slice 文件用于配置每个用户的资源限制。下面是一个示例配置文...