裕策生物科技有限公司招聘启事 裕策生物是一家专注于肿瘤基因组大数据分析的公司，目标是基于机器学习算法及深度挖掘技术，对肿瘤基因组、临床大数据进行分析，开发一个以精准免疫治疗为核心的基因检测及大数据分析...

（一）gradient_accumulate_steps 对于模型训练来说，batch_size越大，模型效果会越好。但是某些环境下，没有足够的GPU来支撑起大的batch_size，因此这时可以考虑...

序 言 接触HiC数据有一些时日了，想着总结一下关于HiC的一些特定术语以及数据分析的相关软件，做为备忘录的同时也可以方便后来的人。 先从概念开始，下面的示意图基本完美地展示了那些耳熟能详的术语所定义...

ImgaeJ是一款比较常用的科研图片分析软件，在之前已介绍过用它来进行细胞计数、不同颜色通道的荧光照片的融合和不规则区域面积的测定等（参见 拓展阅读部分）。 其实，它被广泛用于胶图条带的定量分析，如下...

学术论文和杂志中最常见的是用“字母”和“星号”标记差异显著性，在之前的文章《显著性分析后如何标记“abc”？》已经介绍过如何用SPSS比较均值的结果进行“纯手动”添加字母显著性标记。嗯，方法似乎非常“...

随着 AlphaFold2 成为爆款功能预测软件之后，已经有不少极道科技的客户单位尝试运行过 AlphaFold2了。其实在上一篇使用篇的时候《AlphaFold2与蛋白质三维结构-使用方法》，我们已...

接着上期的AlphaFold2出现《AlphaFold2与蛋白质三维结构-背景介绍》之前，针对蛋白质结构预测领域的一些成就。其实在AlphaFold2出现之前，已经有不少相对成功的算法和应用出现了，但...

在之前的3篇关于EvolView文章中已介绍过进化树的调整和注释，并重点介绍了进化树与条形图、热图、蛋白结构域的组合操作。这次为大家介绍另一种常见的组合图：进化树+点状图。   由于内容上有...

在一些高分文章中，我们经常会看到一些非常漂亮的进化树，而进化树的美化往往离不开一些进化树编辑可视化工具。比如下图这篇NC文章的进化树就是由MEGA构建，之后用一款叫FigTree的小工具美化的。 &n...

氨基酸的疏水性（Hydrophobicity）反映蛋白质的折叠情况，在潜在的跨膜区域会出现疏水区，并且在保持蛋白质的三级结构上（比如维持生物膜的结构）起重要作用。蛋白的亲疏水性（Hydropathic...