数据自身的质量在很大程度上决定了分析结果的准确和可靠，随着Hi-C技术在三维基因组学上的快速推广，对于Hi-C数据本身的质量和测序深度也逐渐引起研究人员的重视。同时对该技术的进一步优化和改进使之能够在...

声明：本文为QIIME2官方帮助文档的中文版，由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效，文档翻译己获QIIME2团队官方授权。由于QIIME2更新频繁，如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读...

作者：陈亮 单位：中科院微生物所， 编辑： 刘永鑫 编者按：上个月菌群月坛，在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验，不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识，更使我手上一个关于菌根的课题有极大的...

1.背景 GWAS研究产生了大量的SNP，大部分在非编码基因组 这些SNP其实是Lead/Tag SNP，所以需要同时关注与这些SNP处于高LD（linkage disequilibrium）的其它S...

线性判别分析LDA 线性判别分析，英文Linear Discriminant Analysis, 以下简称LDA。LDA在模式识别领域（比如人脸识别，舰艇识别等图形图像识别领域）中有非常广泛的应用，在...

时至今日，科研文章也紧随时代潮流，文章中各种高大上的配图层出不穷。究其原因主要包括两点：一是在科研数据和内容更加丰满而文章发表配图张数受限的情况下组合图更具实用性；二是一幅高颜值的配图不仅能提升文章的...

对于有很多(成百上千)研究对象时，把对象分组是最常用的研究手段。而通过观察值进行聚类是非常有效的方法，可以按事物观察值有效的合理分组，再进一步分析各组的相同、与不同，可以很好的发现其中的规律。 本文将...

在深度学习中，常常会遇到batch size, step(iteration), epoch等词。对于很多新手不太清楚这些词之间的关系是什么。这里做一个简单介绍。 名词 定义和含义 epoch 一个e...

做完实验， 又要苦逼地整理数据， 绘制学术图表了？ 今天让我们一起学习下 那些关于论文Figures， 你不能不知道的秘密 科技研究资料经过整理和计算各种必要的统计指标后，所得的结果除了使用适当的文字...

提了一下如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记,本文将详细介绍。利用数据集ToothGrowth进行演示 #先加载包 library(ggpubr) #加载数据集Too...