R语言是比较常用的统计分析和绘图语言，拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库，是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一，支持纯R...

CIRCOS图在有了染色体信息界定绘图区域后，就可以向里面添加离散数据如标记特定的区域或连续数据如展示修饰的丰度等。 经过前面部分对CIRCOS基本安装，最简单绘图和调整各部分属性的熟悉后，这些基本配...

CIRCOS圈图绘制 - 最简单绘图和解释介绍了CIRCOS的安装、基本的配置文件的解释、如何最简单的获得一个CIRCOS图。最主要的部分还是配置文件的位置信息和各个参数的含义解释。 本篇则处理染色体...

Circos是绘制圈图的神器，在http://circos.ca/images/页面有很多CIRCOS可视化的示例。 Circos可以在线使用，在线使用时是把表格转为圈图，不过只允许最大75行和75列...

1、HDF5介绍 HDF 是用于存储和分发科学数据的一种自我描述、多对象文件格式。HDF 是由美国国家超级计算应用中心（NCSA）创建的，以满足不同群体的科学家在不同工程项目领域之需要。HDF 可以表...

多因素线性回归是我们在临床研究中经常用到的，在做完回归后大家往往喜欢问这些影响因素中谁的影响效应最大呢?同时，在SPSS线性回归分析的结果中有标准化回归系数这一列，这一列又是用来做什么的呢?本文就跟大...

关于对照 说到实验设计就不得不提到对照。从小老师教育我们，没有对照组的实验是不完整的，或者说就没有任何意义。所有的生化湿实验都很讲究完整的正对照和负对照。当然，下面的实验我都没做过。。。 蛋白相关实验...

train loss 不断下降，test loss不断下降，说明网络仍在学习;（最好的） train loss 不断下降，test loss趋于不变，说明网络过拟合;（max pool, dropou...

IGV是本地浏览测序数据功能最为强大的基因组浏览器，支持多种不同类型的输入格式和不同的显示方式，如峰图、线图、柱状图、Sashimi-plot。同时还可以配合bedtools使用。 新版的Window...

【前言】其实这篇文章是为了简单介绍一下geneview的用法，它是一个Python高级库，建立在matplotlib的基础之上，专门用于基因组数据的可视化，目的是为了使创建高大上（精致）的基因组数据图...