ANI概念 Average Nucleotide Identity (ANI) 是在核酸水平，两两基因组之间所有直系同源蛋白编码基因的相似性，常用于研究基因组之间的进化距离。相较于传统的 DNA-DN...

SOAPdenovo特点 宏基因组denovo组装软件中SOAPdenovo（http://soap.genomics.org.cn/soapdenovo）的使用较为广泛，其具有组装速度快，N50值较...

Binning分析指把宏基因组中不同个体微生物序列分开，使得同一类序列聚集在一起的过程，其中常见的是同种菌株的序列聚类在一起。进行binning分析可以宏基因组数据中复杂的功能信息定位到菌株水平，方便...

扩增子测序不同于其他高通量测序项目，扩增子测序往往样品量较大，但单个样品的数据量要求不高（因为仅仅研究扩增区域的序列）。为了节约成本，研究者们通常会把多个样品混在一个文库，并给不同样品加上一段 Bar...

主成分分析简介 主成分分析 (PCA, principal component analysis)是一种数学降维方法, 利用正交变换 (orthogonal transformation)把一系列可能...