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Deeptools 对数据质量控制的命令包含如下 plotCorrelation plotPCA plotFingerprint bamPEFragmentSize computeGCBias plo...

最近大量跑chip-seq，看到一篇2016Cell的文章《Cistrome and Epicistrome Features Shape the Regulatory DNA Landscape》感...

批次效应(batch effect)简单说来就是因为实验做了几个批次导致的实验误差，比如芯片数据，每次都要用机器读取，那么光照时间和强度每次都可能不一样， 极有可能出现批次效应。 再比如，实验的三个重...

目前，随着单细胞RNA测序技术（scRNA）的成熟，新的测序方案不断出现。那么，各种技术平台的性能如何呢？优缺点有哪些呢？如何根据我们的研究目的选择合理的单细胞RNA测序技术呢？ 本文系统的比较了6种...

在分类预测中，我们一般比较关注准确率，但是，混淆矩阵也是非常重要的。尤其是当我们都其中的某一类别特别感兴趣的时候，通常要单独的看这个类别的召回率和精度，比如在癌症诊断过程中，我们宁愿错误的认为一个人是...