Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a priori de...

基因集富集分析（Gene Set EnrichmentAnalysis, GSEA），根据名称我们就可以知道这是一种对基因进行富集的工具和方法。 其基本思想是使用预设定的基因集（通常是基因组注释信息或...

基因通路富集分析 (gene set pathway enrichment analysis) 是在一组基因或蛋白中找到一类过表达的基因或蛋白。一般是高通量实验，如基因芯片，RNA-Seq，蛋白质组学...

1. 介绍 任何语言的包，依赖和环境管理：Python，R，Ruby，Lua，Scala，Java，Javascript，C / C ++，FORTRAN Conda是一个开源包管理系统和环境管理系统...

一、生存分析(survival analysis)的定义 生存分析：对一个或多个非负随机变量进行统计推断，研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科。 生存分析：既考虑结果又考虑生存时间的一种统...

主成分分析（PCA）是一种数据降维技巧，它能将大量相关变量转化为一组很少的不相关变量，这些无关变量称为主成分。例如，使用PCA可将30个相关（很可能冗余）的环境变量转化为5个无关的成分变量，并且尽可能...

一、定义 下面是大佬给出来的关于批次效应(batch effect)的定义： Batch effects are sub-groups of measurements that have qualit...

R语言是比较常用的统计分析和绘图语言，拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库，是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一，支持纯R...

WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法，可以用来鉴定...

Deeptools 对数据质量控制的命令包含如下 plotCorrelation plotPCA plotFingerprint bamPEFragmentSize computeGCBias plo...