为了确保单细胞转录组分析工具的可用性,许多开发人员已经做出了相当大的努力。到2021年5月28日,已经开发并提供了近1000种不同的生物信息学工具。 01 数据预处理 单细胞转录组原始测序数据的基本格...
ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同
ATAC-Seq简介 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是201...
tensorflow学习:参数初始化(initializer)
CNN中最重要的就是参数了,包括W,b。 我们训练CNN的最终目的就是得到最好的参数,使得目标函数取得最小值。参数的初始化也同样重要,因此微调受到很多人的重视,那么tf提供了哪些初始化参数的方法呢,我...
单细胞测序扫盲
一、什么是单细胞测序? 如果简单地说,单细胞测序就是获取单个细胞遗传信息的测序技术,似乎没有多大的帮助。为了理解这个问题,咱们不妨先来了解一下测序技术到底可以做些什么。 目前,测序可以回答以下6类问题...
关于global average pooling理解和介绍
Golbal Average Pooling 第一次出现在论文Network in Network中,后来又很多工作延续使用了GAP,实验证明:Global Average Pooling确实可以提高...
卷积神经网络中的softmax,softmax loss和cross entropy的讲解
我们知道卷积神经网络(CNN)在图像领域的应用已经非常广泛了,一般一个CNN网络主要包含卷积层,池化层(pooling),全连接层,损失层等。虽然现在已经开源了很多深度学习框架(比如MxNet,Caf...
谈谈深度学习中的 Batch_Size
首先,为什么需要有 Batch_Size 这个参数? Batch 的选择,首先决定的是下降的方向。如果数据集比较小,完全可以采用全数据集 ( Full Batch Learning )的形式,这样做至...
卷积神经网络术语:梯度下降、Epoch、Batch Size和迭代
你肯定经历过这样的时刻,看着电脑屏幕抓着头,困惑着:「为什么我会在代码中使用这四个术语,它们有什么区别吗?」因为它们看起来实在太相似了。 为了理解这些术语有什么不同,你需要了解一些关于机器学习的术语,...
神经网络术语:Epoch、Batch Size和迭代
batchsize:中文翻译为批大小(批尺寸)。 简单点说,批量大小将决定我们一次训练的样本数目。 batch_size将影响到模型的优化程度和速度。 为什么需要有 Batch_Size : batc...
图解机器学习:人人都能懂的算法原理
算法公式挺费神,机器学习太伤人。任何一个刚入门机器学习的人都会被复杂的公式和晦涩难懂的术语吓到。但其实,如果有通俗易懂的图解,理解机器学习的原理就会非常容易。本文整理了一篇博客文章的内容,读者可根据这...