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ATAC-Seq分析教程：差异peaks分析——DiffBind
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ATAC-Seq分析教程：用网页版工具做功能分析和motif分析
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ATAC-Seq分析教程：用ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
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ATAC-Seq分析教程：重复样本的处理-IDR
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ATAC-Seq分析教程：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）ChIPQC
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ATAC-Seq分析教程：用MACS2软件call peaks
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深入了解tensorlow运行原理
导读：“我叫 Jacob，是谷歌 AI Residency 项目的学者。2017 年夏天我进入这个项目的时候，我自己的编程经验很丰富，对机器学习理解也很深刻，但以前我从未使用过 Tensorflow。...
bismark 识别甲基化位点-比对篇
bismark 软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点，首先需要对基因组建立索引，建好索引之后，就可以开始比对了。 我用的软件自带的单端测序的数据集进行测试， 命令如下 bismark hg19...
bismark 识别甲基化位点
在bismark中，根据甲基化的C所处的上下文环境，分成以下3类； CpG CHG CHH p代表磷酸二酯键，CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。H代表除了G碱基之外的其他碱基，即A, C, T...