在之前的Evolview系列文章已为大家介绍过进化树与条形图、点图、热图以及蛋白结构域组合绘制,今天重点介绍进化树的装饰以及按簇进行分组美化。比如,学习绘制Evolview最美的一个展示案例(show...
gggenes绘制多物种基因结构比较
gggenes是ggplot2的扩展包,用于绘制基因结构图、多物种基因比较图的很好玩的工具。https://wilkox.org/gggenes/ 安装 一种是安装稳定版本的gggene instal...
本地安装UCSC基因组浏览器
CSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。拥有了本地浏览器,就可以对自己的测序数据进行更深入的分析和共享使用。本文详细介绍了如何一步步在本地安装、配置、高级使用UC...
DESeq2差异基因分析和批次效应移除
基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异,最简单的标准化方式是计算 counts per million (CPM),即原始reads count除以总reads数乘以1,000,000。 这种计算方...