经常有童鞋问如何绘制进化树和条形图、热图等的组合图,大神们经常会推荐大家用iTol。但由于iTOL是国外的网站,于是大家经常会遇到iTOL无法登陆的情况。 今天为大家介绍一个类似iTOL的进化树在线美...
SMRT Analysis软件安装
pacbio 公司把三代测序常用软件整合起来,做成了一个在线的分析软件,类似于galaxy; 安装过程如下,参考官网给的指导手册 http://www.pacb.com/wp-content/uplo...
直白介绍卷积神经网络
什么是卷积神经网络,它为何重要? 卷积神经网络(也称作 ConvNets 或 CNN)是神经网络的一种,它在图像识别和分类等领域已被证明非常有效。 卷积神经网络除了为机器人和自动驾驶汽车的视觉助力之外...
深度学习教程之基于代码一步一步教你深度学习中Transformer的原理
首先把所有代码放在一块,整体上了解一下transformer的结构和原理,后面继续分段介绍。 以下是一个基于代码的简单示例,演示Transformer模型的原理: import torch impor...
30分钟手把手带你入门TensorFlow——Mnist手写数字识别实战教程
这一次将会带领大家实现mnist的手写数字识别,手把手教会你如何使用TensorFlow进行基本的操作。本次课程中,将会事无巨细地深入讲解每一个操作细节,为每一位读者提供最贴心的服务。 准备工作 安装...
使用高版本SMRT Analysis软件对Pacbio reads进行基因组De novo组装
1. SMRT Analysis简介 SMRT Analysis软件是由Pacbio Science公司开发的软件,现在是SMRT Link软件的一部分,用于对Pacbio Long Reads数据进...
Tensorflow一些常用基本概念与函数(4)
摘要:本系列主要对tf的一些常用概念与方法进行描述。本文主要针对tensorflow的模型训练Training与测试Testing等相关函数进行讲解。为‘Tensorflow一些常用基本概念与函数’系...
Tensorflow一些常用基本概念与函数(3)
摘要:本系列主要对tf的一些常用概念与方法进行描述。本文主要针对tensorflow的数据IO、图的运行等相关函数进行讲解。为‘Tensorflow一些常用基本概念与函数’系列之三。 1、序言 本文所...
scRNA-seq单细胞转录组数据分析流程
为了确保单细胞转录组分析工具的可用性,许多开发人员已经做出了相当大的努力。到2021年5月28日,已经开发并提供了近1000种不同的生物信息学工具。 01 数据预处理 单细胞转录组原始测序数据的基本格...
ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同
ATAC-Seq简介 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是201...