在当前许多各种不同的生物学研究中,用于产生和理解全局基因表达分析数据的常见假设能够导致关于基因活性和细胞行为方面严重缺陷性的结论。相关研究结果刊登在Cell期刊上。 怀海德研究所研究员Richard ...
新成果颠覆蛋白质经典学说
一直以来学生们被教授蛋白质的三维形状对于它的功能是至关重要的,但原来许多的蛋白质是以“混乱”的状态存在且具有功能。 如果你打开任何一本生物学教材翻到蛋白质的部分,你将会学到蛋白质是由氨基酸序列组成,序...
超越5种碱基的DNA测序
DNA测序已经为科学家提供了丰富的关于生物系统的信息,不过迄今为止的研究大多集中在对基因组DNA序列和重亚硫酸盐处理后的碱基序列进行比较,分析四种标准碱基和5-甲基胞嘧啶。研究显示核苷酸的许多其他化学...
利用Ion半导体测序开展基因表达谱分析
新一代测序技术的出现改变了基因表达谱分析和转录组研究。在其他方法还依赖预知信息进行杂交探针或qPCR引物设计时,RNA-Seq技术可直接对测序文库中任一RNA分子进行无假设的分析。RNA-Seq技术不...
果蝇性染色体的进化过程追踪
果蝇常被用来进行遗传研究,因为其寿命比较短,而且在实验室可以很容易繁殖,其突变体可以被广泛使用。目前果蝇有1500中已知的种。近日一项刊登在Science上的研究追踪了果蝇一对性染色体的进化历程,这对...
最新研究质疑RNA测序数据的统计分析
过去几年间,高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果,其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是,这些调查结果现在受到了挑战,计算生物学家警告说,在这些数据密集型研究(data-int...
基因组装配新前沿:长片段完成完整的基因组
PacBio®长读序为基因组完成带来了新变革。资深基因组装配专家开发的错误校正软件使科学家能在其短读取数据中添加长读序数据,最终将那些未完成的基因组补全。 在过去的十年,基因组装配让一些科学家渴望转向...
千年基因率先推出454+(GS FLX+)转录组测序
自罗氏旗下454生命科学推出测序读长达1,000 bp的454+(GS FLX+)测序系统以来,千年基因已利用该平台成功开展了大量全基因组测序项目。其中,苣苔的全基因组de novo测序组装已经初步完...
扩充遗传字母表也许并不难
Scripps研究所科学家的一项新研究显示,DNA的复制过程其实比人们设想的更开放,更能兼容人造碱基对。 生物体的遗传信息由C、G、A 、T 4种碱基组成的,这四种碱基组成了“DNA的字母表”。人为扩...
各种高通量测序仪比较
高通量测序技术发展的真是快啊,454最近发布的GS FLX Titanium XL+系统的测序长度已经可达700~1000bp了!!通量700M,运行时间23小时。资料请看这里。虽然454的通量有点低...