在这篇文章中,我想谈谈颜色量化以及如何使用k-means聚类算法来执行它,以及优化其方法。 这里提供的代码是用python编写的,来自这个项目。 什么是颜色量化? 颜色量化是指一个减少在图像中的颜色数...
SPSS方差分析应用及结果解读
对于两组独立样本t检验,相信大家都了解。那么如果不是两组样本,而是三组(或以上)的样本,想要比较组间均数时,就要用方差分析了。 下面还是用例子来说话吧~ 一年级开学了,这个班级的小朋友来自三个区县,比...
odds、OR和RR的计算公式和实际意义
1. Odds Odds 的意思为机率、可能性,是指某事件发生的可能性(概率)与不发生的可能性(概率)之比。假如某药物有疗效的比例为p1,则无效的比为1-p1,则odds的计算公式为: 对于如下表所示...
OR(Odd Ratio) – 比值比
R值的全称是odd ratio, OR值是相对危险度,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。 计算公式如下: Odd ratio, 95% CI 假定我们要鉴别一...
怎么区分OR和RR?
一、先举个例子回顾下RR 之前,医咖会专门发了文章讲相对危险度(Relative Risk, RR)。队列研究中,研究者前瞻性地观察“暴露组”和“非暴露组”的发病情况,之后通过RR来评价暴露组研究对象...
碱基平衡性与barcode选择
碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
WGCNA知识点详解
什么是WGCNA分析? WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis),是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方...
下载最新版GO
首先要明白,需要下载什么? 要下载四万多条GO记录的详细信息(http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo) 要下载GO与GO之间的关系(http://...
NCBI SRA数据库使用详解
做为一个合格的生物信息菜鸟,没钱测序咋整,免不了到处求数据呀找数据.....练好基本功必须先从找数据开始!今天小编就来介绍一下一个存储大量高通量数据的的数据库-SRA。 1、简介 SRA(Sequen...
JASPAR:转录因子motif数据库
JASPAR是一个免费公开的转录因子数据库,在该数据库中收录了转录因子的mitif信息,可以用来预测转录因子与序列的结合区域。网址如下 http://jaspar.genereg.net/ 在该数据库...