Bioinformatics

使用K-means进行颜色量化

在这篇文章中,我想谈谈颜色量化以及如何使用k-means聚类算法来执行它,以及优化其方法。 这里提供的代码是用python编写的,来自这个项目。 什么是颜色量化? 颜色量化是指一个减少在图像中的颜色数...
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SPSS方差分析应用及结果解读

对于两组独立样本t检验,相信大家都了解。那么如果不是两组样本,而是三组(或以上)的样本,想要比较组间均数时,就要用方差分析了。 下面还是用例子来说话吧~ 一年级开学了,这个班级的小朋友来自三个区县,比...
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OR(Odd Ratio) – 比值比

R值的全称是odd ratio, OR值是相对危险度,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。 计算公式如下: Odd ratio, 95% CI 假定我们要鉴别一...
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怎么区分OR和RR?

一、先举个例子回顾下RR 之前,医咖会专门发了文章讲相对危险度(Relative Risk, RR)。队列研究中,研究者前瞻性地观察“暴露组”和“非暴露组”的发病情况,之后通过RR来评价暴露组研究对象...
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碱基平衡性与barcode选择

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
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WGCNA知识点详解

什么是WGCNA分析? WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis),是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方...
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下载最新版GO

首先要明白,需要下载什么? 要下载四万多条GO记录的详细信息(http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo) 要下载GO与GO之间的关系(http://...
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NCBI SRA数据库使用详解

做为一个合格的生物信息菜鸟,没钱测序咋整,免不了到处求数据呀找数据.....练好基本功必须先从找数据开始!今天小编就来介绍一下一个存储大量高通量数据的的数据库-SRA。 1、简介 SRA(Sequen...
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