在日常的统计分析中,标准差和标准误是一对十分重要的统计量,两者有区别也有联系。但是很多人却没有弄清其中的差异,经常性地进行一些错误的使用。对于标准差与标准误的区别,很多书上这样表达:标准差表示数据的离...
R中字符串处理和grep的用法
R通常被用来进行数值计算比较多,字符串处理相对较少,而且关于字符串的函数也不多,用得多的就是substr、strsplit、paste、regexpr这几个了。实际上R关于字符串处理的功能是非常强大的...
ABI测序仪
过去20年,美国应用生物系统公司(ABI)在测序方面一直占据着垄断地位。自公司的共同创始人Leroy Hood在上世纪80年代中期设计了第一台自动荧光测序仪之后,生命科学研究就摆脱了手工测序的繁琐和辛...
ROCH-454 测序仪介绍
454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里...
Illumina 测序仪介绍
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其专利核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化...
关于RefSeq:NCBI参考序列
NCBI的参考序列计划(RefSeq)将为中心法则中自然存在的分子,从染色体到mRNA到蛋白提供参考序列标准。RefSeq标准为人类基因组的功能注解提供一个基础。它们为突变分析,基因表达研究,和多态发...
NCBI参考序列(RefSeq)常见问题回答
1,什么是参考序列RefSeq? NCBI的参考序列(RefSeq)计划,为多种生物提供序列的数据信息及相关资料,用于医学、基因功能和基因功能比较研究。RefSeq数据库中所有的数据是一个非冗余的、提...
Running newbler: de novo assembly
This post is about how to start up newbler for de novo assembly projects. I will describe setting up...
Newbler output I: the 454NewblerMetrics.txt file
With this post, I’ll start going through the output files newbler generates. Some of these will be d...
线性回归的假设和pearson相关系数的假设
pearson相关系数是最经常使用的相关系数,一般情况下我们会毫不犹豫的选择它,而大部分情况下都没有考虑到数据是否符合它的假设,如下所示: 1 两个变量间有线性关系 2 变量是连续变量 3 变量均符合...