向GenBank提交数据提交序列有两种方式,一个是在线的页面提交序列bankit,另一个是通过NCBI的Sequin软件提交序列。从使用方便性上来说,两者均需要填写所必须的各项资料,也都是很麻烦,但后...
利用cDNA进行基因电子克隆简介
这是一篇介绍电子克隆技术和方法的文章,个人感觉很不错,多读这种文章,一方面可以把我们在教材上学到的知识连贯起来,融会贯通,真正成为自己的一部分,另一方面了解当代生物科学研究的方向和进展,可以以此为基础...
UCSC:基因组相关研究的一个有力工具
UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供...
利用Weka做K-means聚类
聚类分析中的“类”(cluster)和分类的“类”(class)是不同的,对cluster更加准确的翻译应该是“簇”。聚类的任务是把所有的实例分配到若干的簇,使得同一个簇的实例聚集在一个簇中心的周围,...
MEME:基于motif的序列分析工具
最近在做一个细菌的转录组的课题,其中一个任务是寻找CRP依赖的基因和operon的promoter序列。网上搜了一些资料。Virtual Footprint可以实现一些功能。但是Virtual Foo...
Promoter预测的相关软件及各个软件比较
在过去几年各个实验室都开发了不同的Promoter prediction program(启动子预测软件),但每个promoter预测软件设计的立足点各有差异,如何选择一直以来是大家比较关注的问题。 ...
Circos入门教程
安装前的一些准备 Config::General File::Basename File::Spec::Functions GD GD::Polyline Getopt::Long IO::File ...
Circos:系统生物学里一个画图工具
Circos是一款非常不错的画图工具,可以广泛用于系统生物学、生物信息学。下面是相关介绍。 Circos is a software package for visualizing data and ...
BioInfoServ:一款基于web的生物信息平台系统
BioInfoServ是一个基于Xubuntu Linux构建和开发,以生命科学研究及生物信息分析为应用目的的生物信息平台系统。BioInfoServ具有良好的生物信息运行环境及用户分析界面,包含上百...
python 与 字符串的全排列
问题的引入: 在处理DNA数据的时候,我们可能想枚举n-turple的全部可能形式。 即1-turple的时候,对应 ['A','T','C','G'] 而2-turple的时候,对应['AA','A...