2021年7月23日，笔者的朋友圈被AlphaFold2 的新闻刷屏了。不得不说，Google再一次通过自身强大的计算资源和技术优势，让世界瞠目结舌。本文意在向各位读者介绍一下蛋白质三维结构与 Alp...

本期我将介绍一下非 root 用户如何安装 Python 的包以及群体遗传结构分析常用软件 fastStructure 的安装和使用。 非 root 用户安装 Python 的包 非 root 用户安...

说到富集，富集是将基因根据一些先验的知识（也就是常见的注释）进行分类的过程。我们一般会想到最常见的是GO/KEGG富集，其思路是先筛选差异基因，然后确定这些差异基因的GO/KEGG注释，然后通过超几何...

OS 总体生存期： Overall Survival 定义： 结局指标是死亡时间，这个死亡是任何原因导致的死亡都算进去，只关心是否死亡，不关心因为何种原因死亡。 优点 ： 能比较方便的记录，因为患者死...

在机器学习中，ROC（Receiver Operator Characteristic）曲线被广泛应用于二分类问题中来评估分类器的可信度，但是当处理一些高度不均衡的数据集时，PR曲线能表现出更多的信息...

关于批量相关性分析，我们发过两个帖子。单基因批量相关性分析的妙用，又是神器!基于单基因批量相关性分析的GSEA。两两分析的肯定也是没有问题： 　　现在的问题是，如果是多个基因分相关性分析，如何快速，方...

1.已经确定研究的基因，但是想探索他潜在的功能，可以通过跟这个基因表达最相关的基因来反推他的功能，这种方法在英语中称为guilt of association，协同犯罪。 2.我们的注释方法依赖于TC...

1.已经确定研究的基因，但是想探索他潜在的功能，可以通过跟这个基因表达最相关的基因来反推他的功能，这种方法在英语中称为guilt of association，协同犯罪。 2.我们的注释方法依赖于TC...

都说可以借助ROC分析的曲线坐标确定最优界值(optimal cut off)，但看着SPSS的结果，有些小伙伴不免沉思，到底如何着手呀?(至于如何得到曲线坐标，在ROC分析界面选中ROC曲线的坐标点...

一，下载该软件 wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz ta...