最近有人问我关于ATAC-Seq与ChIP-Seq的区别。刚好在分析ATAC-Seq和DNase-Seq的数据,于是做了个简单介绍。在六六_ryx的博客里面看到下面的介绍,做了简单修改放在这里跟大家分...
一文了解ATAC-seq
Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing(ATAC-Seq)即利用转座酶探究可接近性染色质高通...
鉴定可重复的Peaks
ATAC-Seq/ChIP-Seq通常需要2个会更多的生物学重复(十分珍贵或者稀有样本除外,但必须做至少2次技术重复)。理论上重复样本的peaks应该有高度的一致性,实际情况并不完全与预期一致。如何评...
ATAC-Seq分析教程:ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
ATAC-Seq分析教程系列 ATAC-Seq分析教程:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同 ATAC-Seq分析教程:原始数据的质控、比对和过滤 ATAC-Seq分析教程:用MAC...
ATAC-Seq分析教程:差异peaks分析——DiffBind
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ATAC-Seq分析教程:用网页版工具做功能分析和motif分析
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ATAC-Seq分析教程:用ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
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ATAC-Seq分析教程:重复样本的处理-IDR
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ATAC-Seq分析教程:对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估(二)ChIPQC
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ATAC-Seq分析教程:用MACS2软件call peaks
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