Epigenetics

ChIP-Seq分析小实战(一)

ChIP-Seq分析小实战(一) ChIP-Seq分析小实战(二) ChIP-Seq分析小实战(三) ChIP知识点的梳理 ChIP属于表观遗传学中的一门技术,我第一次了解表观遗传学是通过一本叫遗传的...
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Chip-seq处理流程

本文将以MACS为例,介绍ChIP-seq数据的处理流程。为节省篇幅,本文略去测序数据预处理、mapping reads等步骤,直接从peak-calling开始讲起。 一、首先粗略地介绍一下MACS...
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甲基化测序方法及比较

甲基化测序方法有多种,以上列举了十几种,相信这也使大家经常会用到的种类,其中不知包含了甲基化研究的方法,还包含了羟甲基化的研究方法,当然现有的羟甲基化研究手段还不是很成熟,至少在我接触到的老师当中,很...
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MACS2 安装

最近在学习和使用MACS2,由于Ubuntu的一些配置问题,致使在MACS2的安装始终遇到中断,在查询很多资料以后,最终安装成功,现在与大家在这里一起分享: 1)下载MACS2 $ python se...
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