细菌基因组比较分析是时下很火热的研究方向，通过比较能够获得两个或多个基因组之间的共性及异性，在系统进化分析，物种分类鉴定，功能研究等领域中具有重要价值。 如何直观地展示基因组结构之间的相似性？BRIG...

Sinha, R., et al 近期在 bioRxiv上发布了一篇题为 ‘Index switching causes “spreading-of-signal” among multiplexed...

1，vcf格式说明 VCF格式：Variant Call Format，用于记录variants (SNP / InDel)的文件格式，关于其说明，详见：http://gatkforums.broad...

在做生物信息分析的时候经常会遇到一种尴尬的问题就是不同来源或者版本的注释文件里面，基因名称不一致。譬如P53，其实它的标准名称为TP53。CXCR4的曾用名有一堆，CD184, D2S201E, FB...

Maftools系列文章： 《maftools使用方法总结以及常见问题》 《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》 《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

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本文作为总结篇，将在这里对已经写过的几篇文章内容进行概括，可作为整个系列文章的目录，此外还有一些常见问题的解决方法。加上本篇目前一共写了5篇maftools相关文章，基本上按照整个官方文档使用TCGA...

第一次听说这个软件，是一个香港朋友推荐的：http://davetang.org/muse/2016/01/13/getting-started-with-gemini/ 他写的很棒，但是我当初以为是...