作者：牛登科 学过生物学的人可能都知道乳糖操纵子。在大肠杆菌基因组中，乳糖分解、运输的三个基因连在一起，由前端共同的Promoter区域调节三个基因的表达。这三个基因，就像俗话中一根绳上的蚂蚱。操纵子...

在利用基因芯片或者RNA-seq做基因表达分析的时候，经常听说生物学重复和技术重复，这篇文章我们就来简单介绍二者的含义。 首先利用一张示意图对二者做一个简单介绍：   使用同一个抽提的RNA...

PCR可以说是目前分子生物学实验中应用最为广泛的一种技术。从最初的在几个水浴锅里把试管放来放去，到现在各种先进的PCR仪， 到REAL TIME PCR。 设备是越来越先进，方法是越来越多，但基本的原...

HDF5 is a data format designed by National Center for Supercomputing Applications at UIUC to rapidly...

最近看到的几篇涉及进化的文章里面都提到selective sweep，特地对这个词进行了了解，搜到了一些资料与大家分享一下。 先贴上维基百科上的介绍： A selective sweep is the...

Pacific bio sequences fall at other extreme from Illumina Solexa data. The reads are very long (~5kB...

Homologous sequences. Orthologs and Paralogs are two types of homologous sequences. Orthology descri...

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变...

Read：高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig：拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig（重叠群）。 Scaffold：基因组de novo测序...

gff格式是Sanger研究所定义，是一种简单的、方便的对于DNA、RNA以及蛋白质序列的特征进行描述的一种数据格式，比如序列的那里到那里是基因，已经成为序列注释的通用格式，比如基因组的基因预测，许多...