在R中,如何实现在一幅图中绘制多个子图呢,特别是当子图是以群组(group)来归类的时候?下面提供两种解决方案: 先虚构一组数据: [plain] Group Class Num A X 80 A Y...
定制R启动环境
本文翻译自R in Action的附录B,如果对该书感兴趣,请自行购买或去图书馆阅读。 R导论的10.8也是讲定制环境的。 程序员最喜欢做的事之一是定制启动环境,好让程序按照他们喜欢方式工作。定制启动...
Linux安装R语言包
1. R包介绍 R的包(package)通常有两种: 二进制代码包(Binary package):这种包属于即得即用型(ready-to-use),但是依赖与平台,比如Windows和Linux平台...
利用Bioperl进行序列输入和输出(Bioperl HOWTO翻译13)
利用BIOPERL进行序列输入和输出 英文原文 注意:由于SyntaxHighlighter的缘故,代码有错误,可能没修改完。 目录 1 作者 2 版权 3 基础 4 十秒速览 5 背景 6 格式 ...
Bioperl入门其他部分(Bioperl HOWTO翻译12)
(译者注:Beginners HOWTO翻译到此结束,从Searching for genes in genomic DNA部分往后都是一些有关bioperl和其他程序接口:调用其他程序并分析结果。专...
Bioperl快速检索序列(Bioperl HOWTO翻译11)
索引序列文件以用于快速检索 英文原文 索引序列是Bioperl一个非常出色的功能。你可以将需要处理的本地序列文件建立一个索引然后利用这个索引提取你所需要的序列文件。这样做最重要的原因是——速度!从有索...
使用Aspera从EBI或NCBI下载基因组数据
做基因组数据分析,可能经常从NCBI的GEO/SRA或者EBI的ENA数据库下载高通量的数据,动辄几十G的数据用wget下载实在太纠结,这时就要用到神器-Aspera了。 使用Aspera,最简单的方...
利用Biperl获取序列基本统计信息(Bioperl HOWTO翻译9)
获取序列基本统计信息 英文原文 除了前面讲的可通过序列对象的不同方法来获取序列文件中已有的序列信息,也可以利用bioperl获取序列的其他一些信息。例如,SeqStats对象可以获取序列的分子质量,单...
利用Biperl进行本地blast(Bioperl HOWTO翻译10)
BLAST 英文原文 (译者注:可以先参考这两篇文章:1)本地blast 2)perl脚本提取BLAST结果中的信息【以tblastn为例】 ) bioperl有很多序列分析软件的接口,这意味着可...
利用Bioperl将编码序列翻译成蛋白质(Bioperl HOWTO翻译8)
翻译 英文原文 在生物信息学中翻译的概念有两种,一是将任意核苷酸序列从头到位顺次翻译;二是将真实的编码序列,如mRNA或cDNA,翻译成相应的氨基酸序列。Bioperl都可处理。 任何alphabet...