BEGINNERS HOWTO 英文原文 原作者 Brian Osborne briano at bioteam.net 版权 原作者保留版权,基于 Perl Artistic License协议可有...
生物信息画图颜色搭配以及颜色卡
最近在用Qt写一个可视化软件,需要预先设定一些颜色搭配。刚好在网上收到了两张不错的颜色搭配图,与大家分享一下。大家在用R、matlab等画图的时候可以参考一下。 颜色搭配图: 各种颜色对应的名称与RB...
Linux、Unix常用命令(文件和目录相关)
mkdir mkdir dirname 建立子目录. 注意:用户不能在一个不存在的目录中建立子目录。 mkdir data 在当前目录下建立子目录 data mkdir /usr/data 在/usr...
用matlab画boxplot中的一些应用说明
由于matlab具有强大的计算功能,用其统计数据功能优点显而易见,这里分享使用matlab中的boxplot的一些技巧,供大家参考。 Matlab boxplot命令 格式如下 boxplot(X):...
perl对中文的处理(encode,decode)
Perl从5.6开始已经开始在内部使用utf8编码来表示字符,也就是说对中文以及其他语言字符的处理应该是完全没有问题的。我们只需要利用好Encode这个模块便能充分发挥Perl的utf8字符的优势了。...
主成份分析(PCA)在生物芯片样本筛选中的应用及在R语言中的实现
主成份分析方法可以对基因芯片的样本聚类情况进行可视化,可获得样本在实验组和对照组之间的直观分布情况,从而便于对异常样本进行检测和去除,否则异常样本的存在将会对差异基因的鉴定等后续分析造成不利影响。下面...
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正
数据分析中常碰见多重检验问题(multiple testing).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(False Discovery Rate)来决定P值的域值. 假设你挑选了...
Ubuntu 安装与更新 GCC
一、程序下载 首先从GNU上下载GCC包,ftp://gcc.gnu.org/,我使用的是最新发布版本gcc-4.7.0.tat.gz, tar zxvf gcc-4.7.0.tar.gz cd gc...
R语言基础入门之五:简单线性回归
线性回归可能是数据分析中最为常用的工具了,如果你认为手上的数据存在着线性定量关系,不妨先画个散点图观察一下,然后用线性回归加以分析。下面简单介绍一下如何在R中进行线性回归。 一、回归建模 我们利用R语...
Perl文件读写操作介绍
一、打开、关闭Perl文件 语法为open(filevar,filename),其中filevar为Perl文件句柄,或者说是程序中用来代表某Perl文件的代号,filename为Perl文件名,其路...