Script

RIdeogram:画染色体图

由小丫画图开始并推动,产生了一个CRAN包——RIdeogram 今天已由CRAN审核通过,一行命令搞定安装: install.packages("RIdeogram") 【需求描述】 我要画差异表达...
阅读全文
Script

Conda工具使用

1. 介绍 任何语言的包,依赖和环境管理:Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,Javascript,C / C ++,FORTRAN Conda是一个开源包管理系统和环境管理系统...
阅读全文
Script

R语言学习 – 入门环境Rstudio安装

R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R...
阅读全文
Script

Conda常用命令

Conda 环境 # 创建一个名为python34的环境,指定Python版本是3.4 conda create --name python34 python=3.4 # 激活某个环境 activat...
阅读全文
Script

R中坐标轴截断的不同实现方式

本文在做学术论文中,正好想做一下把y轴一些数据进行截断的效果。通过网上检索,整理了一下两种方式构建坐标轴截断图。 plotrix包 利用gap.barplot()进进行绘制,将gap参数设置为90,4...
阅读全文
Script

基于R语言绘制坐标轴截断图

画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大,大数据就会掩盖小数据的变化规律,这时候可以对Y轴进行截断,从而可以在不同层面(大数据和小数据层面)全面反映数据变化情况,如下图所示。 搜索截断图绘制的方法,有根...
阅读全文
Script

CONDA使用入门

  近来已经习惯使用 Continuum Analytics 公司的Conda产品作为我的主要开发工具箱. Conda提供比隔离环境包 virtualenv 和 python 版本切换包 p...
阅读全文