1、HDF5介绍 HDF 是用于存储和分发科学数据的一种自我描述、多对象文件格式。HDF 是由美国国家超级计算应用中心(NCSA)创建的,以满足不同群体的科学家在不同工程项目领域之需要。HDF 可以表...
使用Python绘制GWAS分析中的曼哈顿图和QQ图
【前言】其实这篇文章是为了简单介绍一下geneview的用法,它是一个Python高级库,建立在matplotlib的基础之上,专门用于基因组数据的可视化,目的是为了使创建高大上(精致)的基因组数据图...
杂志图表的经典用色
《经济学人》常用的藏青色 经济学人上的图表,基本只用这一个颜色,或加上一些深浅明暗变化,再就是左上角的小红块,成为经济学人图表的招牌样式。罗兰贝格也非常爱用这个色,有时也配合橙色使用。各类提供专业服务...
R绘图基础(10)热图 heatmap
我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
R绘图基础(9)坐标中断(axis breaks)
R当中的坐标中断一般都使用plotrix库中的axis.break(), gap.plot(), gap.barplot(), gap.boxplot()等几个函数来实现,例: gap plot &g...
R绘图基础(8)点柱图(dot histogram)
在之前的一节当中,图型名称有些混乱,从这一节开始将做如下统一(不全面): 英文名称 中文名称 bar 条形图 line 线图 area 面积图 pie 饼图 high-low 高低图 pareto 帕...
R绘图基础(6)各类图型
1、点,线,面 点:points,线:abline,lines,segments,面:box,polygon,polypath,rect,特殊的:arrows,symbols points不仅仅可以画...
R绘图基础(5)坐标轴,图例,标记与标题
相关参数来控制,它们有 参数 描述 main 主标题 sub 副标题 xlab x轴标记 ylab y轴标记 xlim x轴上下限(范围) ylim y轴上下限 mgp 坐标轴标记,坐标字符,坐标刻度...
R绘图基础(4)符号与线形
画图中的符号由pch参数来控制。其描边色由col控制,填充色由bg控制。 > pchShow <- + function(extras = c("*",".", "o","O","0","...
R绘图基础(3)字体
字体参数如下: 参数 描述 font 字体描述,1正常,2加粗,3斜体,4加粗,斜体,5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述...