写在前面的话:关于细胞通讯的工具有很多,cellchat只是其中一个。网上关于CellChat的解读也很多,我在学习的时候也参考了一些,具体参考列表我都在文中标注了哈。这里只是我在学习细胞通讯和Cel...
生物组织内细胞通讯
在多细胞生物组织内,细胞往往通过介质将发送的信息传递给其他细胞。信息一旦发出,其他细胞会做出三种反应:响应、无响应和接收不到。这种模式非常类似于我们用电话跟其他人打电话时的场景,当我们拨打电话之后,对...
单细胞RNA综述的评述:细胞和基因质控参数的选择
原文链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6072887 摘要 单细胞RNA测序技术的发展加深了我们对于细胞作为功能单元的理解,不仅能基于成...
单细胞转录组分析:多样本合并与批次校正
前言 实际的科研项目中不可能只有一个样本,多样本的单细胞数据如何合并在一起,是否需要校正批次效应呢?先上一张图说明多样本scRNA数据的批次效应: 左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起,不考虑去...
新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员...