一、安装breakdancer 1：在安装breakdancer之前必须先安装以下几个包 yum安装以下包： yum -y install perl yum install perl-ExtUtils...

  为全程协助临床医生开展基因组学科研项目，千年基因专门针对临床医生推出了全方位的基因组学项目解决方案，从最初的课题设计、经费申请开始，到提供专业测序分析及结果验证，并最终至科研文章的发表提供全程支持...

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思；复杂度高，碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡，指碱基的组成太单纯了，种类少。碱基复杂度本来无关紧要，从前除了设计PCR的时候考...

二代测序二代测序是做什么的 如何选择好的barcode barcode组合举例 建库测序时barcode是如何发挥作用的 barcode，也叫index，在二代测序里面是用于区分不同样品的。为了避免概...

1 混合样本测序 现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高，数据量远远大于单个样本测序所需，因此在很多情况下，需要把多个样本混合在一起测序，以充分发挥仪器的能力，节约测序成本。像外显子组测序、转录组...

刚接触高通量测序的同学，可能会接触到barcode index等名词。 为什么要有barcodes ？ 原因很简单，一个lane有效数据30来G 我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量，尤其是RNA...

  DNA甲基化分析流程示意图 Workflow of high-throughput DNA methylation analysis. The workflow shows the ba...

当二代测序的原始数据拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projec...

随着测序价格不断降低，二代测序的应用现在可以说是如日中天了，Hiseq，Solexa，454等等。测序数据到手之后第一件要做的事情当然是看看数据测得怎么样了？一般测序机构提供测序数据的同时也会提供一份...

现在的确又不少研究单位和公司开办关于生物信息学、二代测序数据分析等等之类的培训班，说实在这个培训班的效果有多大，确实不好说。但我个人认为，多数这类培训班都是针对生物信息刚入门的学员。因为现在高通量测序...