基因组注释包括以下方面的内容: (1) 重复序列的预测。通过比对已知的重复序列数据库,找出序列中包含的重复序列,识别类型并转化为N或者X,统计各种类型重复序列的分布。 (2) 编码基因的预测。通过将转...
UCSC:基因组相关研究的一个有力工具
UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供...
基因组的编辑改写了生物密码
基因编辑的能力像约翰内斯古腾堡(Johannes Gutenberg)印刷机一样具有革命性、时下可用性以及潜在的无限应用性。大多数DNA编辑工具处理速度慢、价格昂贵以及操作复杂,正像古腾堡发明一样,凝...
Nature年度技术:基因组编辑
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,上周出版的《Nature》杂志也对2011年进行了回顾:365 days: Nature's 10 ,评点了2011年的科技进展,科技政策以及重要人物。其中《Na...
无root权限用户安装ABySS方法
首先引用一下官方对ABYSS的介绍: ABySS is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for ...
物理图谱
【相关概念】 DNA限制性内切酶酶切图谱又称DNA的物理图谱,它由一系列位置确定的多种限制性内切酶酶切位点组成,以直线或环状图式表示。在DNA序列分析、基因组的功能图谱绘制、DNA的无性繁殖、基因文库...
mGene: Accurate Computational Gene Finding
mgene 是一款基于机器学习的方法,从真核基因组序列中预测但白白编码基因的软件。 同时mgene.web是一款web服务程序。 mGene is a computationa...
利用BankIt向NCBI提交序列方法
向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用哪种办法,根据不同的需要。 BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih....