大家在用热图软件，例如，pheatmap绘制热图的之后，经常要面临一个问题就是： 图是画出来了，但如果想从图对应到基因，并查询对应基因的表达量就非常麻烦。因为热图聚类功能会打乱样本和基因的顺序，原来的...

在当前许多各种不同的生物学研究中，用于产生和理解全局基因表达分析数据的常见假设能够导致关于基因活性和细胞行为方面严重缺陷性的结论。相关研究结果刊登在Cell期刊上。 怀海德研究所研究员Richard ...

1、RPKM 方法 根据 RNA-seq 原理，测序过程实际上是对转录组中各转录本打断后随机采样 的过程。因此，当某基因的表达水平较高时，该基因上的读段数就多；当某基因 的长度较长时，该基因上的读段数...

在利用基因芯片或者RNA-seq做基因表达分析的时候，经常听说生物学重复和技术重复，这篇文章我们就来简单介绍二者的含义。 首先利用一张示意图对二者做一个简单介绍：   使用同一个抽提的RNA...

在一个生物体中，任何细胞都带有同样的遗传信息，带有同样的基因，但是，一个基因在不同组织、不同细胞中的表现并不一样，这是由基因调控机制所决定的。遗传信息从DNA传递到蛋白质的过程称为基因表达，对这个过程...