PAML软件中的codeml命令可以使用Maxmum Likelihood方法对密码子或氨基酸的多序列比对结果进行分析和进化参数计算 。这两种数据共用一个命令,程序运行时的参数绝大部分是公用的,但仍需...
遗传密码的新排列和起源探讨
肖景发, 于军 中国科学院北京基因组研究所, 中国科学院“基因组科学及信息”重点实验室 摘要 根据DNA核苷酸组分的动态变化规律将遗传密码的传统排列按密码子对GC和嘌呤含量的敏感性进行了重排. 新密...
利用BioJava将单个密码子翻译成氨基酸
通常的翻译的例子展示了如何使用RNATools将RNA标志链翻译成蛋白质,但是具体细节隐藏在translate()方法中。如果你想将单个的密码子翻译成氨基酸,那么你就要明白具体的细节了。 实际上有很多...