基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异,最简单的标准化方式是计算 counts per million (CPM),即原始reads count除以总reads数乘以1,000,000。 这种计算方...
R语言DESeq找差异基因
一:安装并加装该R包 安装就用source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”) ;biocLite(“DESeq”)即可,如果安装失败,就需要自己下载源码包,然...
别再用DEseq2和edgeR进行大样本差异表达基因分析了
读博那几年,闲着没事就喜欢做各种软件的测试对比。有时候几个转录组样本非得用两三个差异分析方法都做一遍。严谨起来就给它们之间求一个交集,狡猾起来就谁的结果「更好」就用谁(想必你也是这么做的)。 2021...
miRNA测序结果分析
miRNA研究现在是如火中天了,不少同学现在也开始从事这方面研究。有些同学常常会迷惑,因为不知道到底需要做哪些研究。下面简单和大家分享一下miRNA测序后分析的主要内容有哪些。 一、基因注释(推荐) ...