methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包,不仅支持WGBS,RRBS和目的区域甲基化测序,还支持oxBS-sq, TAB-seq等分析5hmc的数据。 其核心功能是差异甲基化分析和差异甲...
bsseq 进行差异甲基化分析
bsseq 主要用来分析WGBS的数据, 安装过程如下 source(“http://bioconductor.org/biocLite.R“) biocLite(“bsseq”) bsseq的分析主...
差异甲基化分析eDMR软件分析说明
软件链接地址:https://code.google.com/p/edmr/ 该软件是可以基于对methylkit 软件包进行 进一步处理的,在处理和找寻差异甲基化为点和区域,分析的要比 methyl...