【絮语】 一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT...

【絮语】 TEXshade 是 Latex 的一个宏包，可以对 MSF或 ALN 格式的多重比对文件以不同的方式进行着色美化，并可以对重要的位置和区域作出标记。用 TEXshade软件包能做出来的多重...

【絮语】 多重比对是核苷酸和氨基酸序列分析的重要内容之一，通过多重比对，可以找出序列的保守区域，可以为分子进化分析提供依据。但由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.a...

1. MAFFT 简介 最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多，有文献报道：比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-...

有趣的是，大部分的short read比对工具都是由中国人写出来的。因此可以说华大基因（BGI， Beijing Genomics Institute, Chinese Academy of Scie...

COBALT is a multiple sequence alignment tool that finds a collection of pairwise constraints derived...

软件的主页是 http://www.drive5.com/muscle/ 进入主页，简单看看软件介绍，这个软件还是蛮牛的，一个人在家里自己写出来的，当然，对于普通人来说，这个软件跟clustalW没什...

多序列比对简介： 双序列比对是序列分析的基础。然而，对于构成基因家族的成组的序列来说，我们要建立多个序列之间的关系，这样才能揭示整个基因家族的特征。多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着...

生物信息学教程系列 第三章 3 序列比对和数据库搜索 比较是科学研究中最常见的方法，通过将研究对象相互比较来寻找对象可能具备的特性。在生物信息学研究中，比对是最常用和最经典的研究手段。 最常见的比对是...

同源序列比对是生物信息学普遍采用的分析方法之一，其中，编码蛋白质DNA序列比对最为常见，在比较基因组学、分子进化学、系统发育等领域具有重要的基础作用。为获取相应的比对结果，通常采用的方法是先比对后回译...