生物信息学很大一部分数据是基于基因组坐标的格式，由于坐标的0，1起始和区间开闭的区别，曾经给我造成了很大的困扰。 0，1起始的定义 格式对应表

生信分析过程中，会与很多不同格式的文件打交道，除了原始测序数据fastq之外，还需要准备基因组文件fasta格式和基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、bed12、...

刚接触生信分析的小白们这种尴尬的事情时有发生，为了帮助大家梳理这些剪不断理还乱的文件，本文以分析流程为主线，介绍各文件的格式以及有哪些常用命令来查看或处理它们。 1. 测序数据FASTQ文件 1）文件...