Genomics

生存分析(survival analysis)

一、生存分析(survival analysis)的定义 生存分析:对一个或多个非负随机变量进行统计推断,研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科。 生存分析:既考虑结果又考虑生存时间的一种统...
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Transcriptomics

GEPIA2使用教程

今天跟大家分享的是一个在线TCGA基因表达和生存分析的工具(GEPIA2),2019年发表在NAR上,目前已更新到2.0版本,访问网址是http://gepia2.cancer-pku.cn/#ind...
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Genomics

如何做生存分析?

生存分析是医学领域常见的分析方法,也可以拓展到其他专业领域。这篇帖子的目的就是介绍怎么做生存分析,希望能对临床医学的同学提供一定帮助。 简明扼要地讲,生存分析的目的无外乎六个字:描述、比较、关系。 1...
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Genomics

GEO数据做生存分析

一、数据下载 打开GEO,选择GSE17538 数据,然后下载MINiML。 二、格式转化 然后导入GEO_Convert.exe 工具。 导出样本信息数据和数据矩阵。 三、格式修改(可以防止踩大坑)...
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Statistics

生存分析样本量的考虑

前段时间,小编写了一篇关于终点指标的选择与样本量计算的微信文章,后来有不少小伙伴留言表示对于生存分析(时依性变量为终点指标)的样本量计算很感兴趣。正好最近听了北大临床研究所统计部主任阎小妍博士讲生存分...
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Statistics

生存分析中生存率的计算

近日连续遇到好几个同事在写临床研究论文时问及生存率的问题,有人还是对生存率的计算有点儿理不清楚,本期就这一问题作一讨论。当然这一讨论仅限于简单的临床研究数据中的Kaplan-Meier法。对于流行病学...
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