Small non-coding RNAs近年来一直研究比较热门,尤其是在真核生物中。因此PLoB网站上面也专门开辟了ncRNA专栏来介绍这一块的研究进展。最近在做一个细菌的转录组课题,需要鉴定其中的...
基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究策略
刘万飞 王西亮 赵宇慧 曾瀞瑶 耿佳宁 胡松年 中国科学院北京基因组研究所 摘要: 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛,选择合适的研究策略变得越来越重要。就基于第二代测序技术的...
与细菌共生
撰文╱阿克曼(Jennifer Ackerman)翻譯╱涂可欣 重点提要 人体内的细菌细胞数是人类细胞的10倍,然而研究人员直到最近,才开始了解微生物对健康的帮助。 有些细菌会制造人体无法合成的有益化...
基因组装配新前沿:长片段完成完整的基因组
PacBio®长读序为基因组完成带来了新变革。资深基因组装配专家开发的错误校正软件使科学家能在其短读取数据中添加长读序数据,最终将那些未完成的基因组补全。 在过去的十年,基因组装配让一些科学家渴望转向...
MEME:基于motif的序列分析工具
最近在做一个细菌的转录组的课题,其中一个任务是寻找CRP依赖的基因和operon的promoter序列。网上搜了一些资料。Virtual Footprint可以实现一些功能。但是Virtual Foo...
比较基因组学分析成为《PNAS》2011年热门文章
临近岁末,《美国国家科学院院刊》(PNAS)公布了今年的10大热点文章,其中包括生物学,医学,机械工程等多个方面。来自美国马里兰大学医学院的研究人员一篇题为“Bacillus anthracis co...