在生物学特别是基因组学的研究工作中,经常会遇到多重假设检验(multiple testing)的问题;此时,得到的原始p值需要进行校正后才能使用,那么哪种校正方法更加适合自己的研究工作呢?p-valu...
关于生物实验中的统计学
最近看到一篇很有意思的博文,关于统计学在心理学中应用引发的讨论。想到平时我们生物信息学分析数据的时候,往往很多结论和推断都是基于统计学意义上进行的,看到这篇博文觉得挺有意思,与生物信息人同飨。下面是博...
R语言基础入门之五:简单线性回归
线性回归可能是数据分析中最为常用的工具了,如果你认为手上的数据存在着线性定量关系,不妨先画个散点图观察一下,然后用线性回归加以分析。下面简单介绍一下如何在R中进行线性回归。 一、回归建模 我们利用R语...
R语言基础入门之六:Logistic回归
让我们用logistic回归来结束本系列的内容吧,本文用例来自于John Maindonald所著的《Data Analysis and Graphics Using R》一书,其中所用的数据集是an...
R语言基础入门之三:常用统计函数运算
在R语言中经常会用到函数,例如上节中讲到的求样本统计量就需要均值函数(mean)和标准差函数(sd)。对于二元数值数据还用到协方差(cov),对于二元分类数据则可以用交叉联列表函数(table)。下文...
R语言基础入门之一:引言
一、什么是R语言 R语言是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。由于R可以通过安装扩展包(Packages)而得到增...
R语言常用函数
基本 一、数据管理 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框c:连接为向量或列表 leng...